本次的故事发生在全新的冒险舞台——“合众地方”。其蓝本是第五世代游戏（口袋妖怪黑白）。小智与皮卡丘和新伙伴艾莉丝、天桐一起展开为了追寻梦想和冒险以及和各种各样神奇宝贝的邂逅的旅行。。女孩Alva活潑好動、常和男孩一起玩，為了融入他們，闖入哥哥們的男生基地，卻是場大開眼界的冒險...。
